Zymo Research เปิดตัวซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศศาสตร์ รองรับการตรวจหาเชื้อโควิดในน้ำเสีย

Zymo Research Corp.

2021-05-11 20:37 326

การเปิดตัว VirSieve^™ Bioinformatics Pipeline จะช่วยส่งเสริมความร่วมมือด้านการวิจัยไวรัส SARS-CoV-2 ในสิ่งแวดล้อม

เออร์ไวน์, แคลิฟอร์เนีย--11 พฤษภาคม 2564--พีอาร์นิวส์ไวร์/อินโฟเควสท์

Zymo Research เปิดตัวซอฟต์แวร์ VirSieve^™ Bioinformatics Pipeline สำหรับชุมชนจุลชีววิทยาสิ่งแวดล้อม เพื่อส่งเสริมความร่วมมือทั่วโลกและสนับสนุนการตรวจหาเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์ต่าง ๆ ในน้ำเสีย โดย VirSieve^™ เป็นซอฟต์แวร์อัตโนมัติที่สามารถวิเคราะห์ลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 จากตัวอย่างน้ำเสีย เพื่อให้เข้าใจมากขึ้นเกี่ยวกับสายพันธุ์ของไวรัสที่พบในชุมชน ซอฟต์แวร์นี้สามารถประเมินช่วงความเชื่อมั่น (confidence interval) ในการกลายพันธุ์ของไวรัส จึงวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสได้อย่างแม่นยำขึ้นมาก

Zymo Research releases the VirSieve™ Open-Source Bioinformatics Pipeline source code to the environmental microbiology community to promote global collaboration and support for the detection of SARS-CoV-2 variants in wastewater.

ศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคของสหรัฐอเมริกา (CDC) ระบุว่า การฉีดวัคซีนมีผลดีอย่างมหาศาลในการควบคุมการแพร่ระบาดของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 ในสหรัฐอเมริกา แต่ยังคงมีไวรัสสายพันธุ์ใหม่เกิดขึ้น โดยบางสายพันธุ์ เช่น B.1.1.7 ถูกจัดว่าเป็น "สายพันธุ์น่ากังวล" เนื่องจากมีหลักฐานว่าแพร่กระจายเร็วขึ้น มีความสามารถในการก่อโรคมากขึ้น หรือดื้อวัคซีนมากขึ้น ด้วยเหตุนี้ การตรวจหาเชื้อในน้ำเสียจึงเป็นทางออกที่เหมาะสมที่สุดในการตรวจตราสถานการณ์ในชุมชนแบบเกือบเรียลไทม์

การตรวจลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสในน้ำเสียเป็นเรื่องที่ทำได้ยาก เนื่องจาก RNA ของไวรัสมีการเสื่อมและแตกกระจาย ส่งผลให้การตรวจลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสเกิดความผิดพลาด จนทำให้เกิดการเข้าใจผิดว่ามีการกลายพันธุ์ อย่างไรก็ดี VirSieve^™ สามารถระบุความผิดพลาดเหล่านี้และแจ้งว่าความน่าเชื่อถือต่ำหรือไม่มีความน่าเชื่อถือ ช่วยให้นักวิจัยสามารถคัดกรองไวรัสกลายพันธุ์โดยมีข้อมูลสนับสนุนที่น่าเชื่อถือมากขึ้น นอกจากนี้ Zymo Research ยังใช้อุปกรณ์เก็บตัวอย่าง DNA/RNA Shield^™ ที่ช่วยปกป้อง RNA ของไวรัสจากการเสื่อมเพิ่มเติม หลังจากที่ทำให้ไวรัสหยุดทำงานเพื่อเก็บในอุณหภูมิที่เหมาะสมและขนส่งตัวอย่างน้ำเสียอย่างปลอดภัย

"ก่อนหน้านี้ Zymo Research ได้พัฒนาซอฟต์แวร์สาธารณะอย่าง Zymo Research Transmit Program สำหรับส่งผลทดสอบโควิด-19 ผ่านระบบรายงานสาธารณสุข CalREDIE" Dr. Michael Weinstein ผู้อำนวยการระบบสารสนเทศทางห้องปฏิบัติการ และหัวหน้าโปรเจค VirSieve^™ Pipeline ของ Zymo Research กล่าว "VirSieve^™ เป็นความพยายามส่วนหนึ่งของ Zymo Research ในการสนับสนุนการรับมือโรคระบาดทั่วโลกอย่างเต็มที่ โดย VirSieve^™ ไม่เพียงมีศักยภาพในการตรวจสอบไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์ต่าง ๆ ในน้ำเสียเท่านั้น แต่ยังรวมถึงไวรัสอื่น ๆ ด้วย จึงสามารถตอบสนองความต้องการด้านสาธารณสุขในอนาคต"

"การตรวจสอบสายพันธุ์ของไวรัสอย่างแม่นยำจากตัวอย่างหรือน้ำเสีย คือกุญแจสำคัญในการระบุสายพันธุ์ไวรัสอย่างถูกต้อง และเป็นประโยชน์ต่อการติดตามจุลินทรีย์ก่อโรค" Dr. Christopher Mason โฆษกของ Zymo Research และผู้อำนวยการร่วมของ WorldQuant Institute for Quantitative Prediction และศาสตราจารย์ภาควิชาสรีรศาสตร์และชีวฟิสิกส์ของ Weill Cornell Medicine กล่าว

สามารถดูข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับ VirSieve^™ Pipeline ได้ที่เว็บไซต์ของ Zymo Research หรือติดต่อที่ tech@zymoresearch.com

เกี่ยวกับ Zymo Research Corp.

Zymo Research เป็นบริษัทเอกชนที่ให้การสนับสนุนแวดวงวิทยาศาสตร์และการวินิจฉัยโรคด้วยเครื่องมือด้านชีวโมเลกุลสุดล้ำมาตั้งแต่ปี 1994 หลักการดำเนินงานของบริษัทคือ "วิทยาศาสตร์เป็นสิ่งสวยงามเพราะทำให้สิ่งต่าง ๆ ง่ายขึ้น" ซึ่งสะท้อนให้เห็นในผลิตภัณฑ์ทุกชิ้นของบริษัท ไม่ว่าจะในเรื่องอีพีเจเนติกส์ไปจนถึงเทคโนโลยีทำให้ DNA/RNA บริสุทธิ์ ทั้งนี้ Zymo Research ได้รับการยกย่องตลอดเวลาที่ผ่านมาว่าเป็นผู้นำในแวดวงอีพีเจเนติกส์ โดยบริษัททลายขีดจำกัดเดิม ๆ ด้วยโซลูชันใหม่ ๆ สำหรับการเก็บตัวอย่าง การวัดไมโครไบโอม อุปกรณ์วินิจฉัย และเทคโนโลยี NGS ที่ล้วนแล้วแต่มีคุณภาพสูงและใช้งานง่าย ติดตาม Zymo Research ได้ทาง Facebook, LinkedIn, Twitter และ Instagram

ดูข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับผลิตภัณฑ์กลุ่มโควิด-19 ของ Zymo Research ได้ที่ลิงก์ด้านล่าง

- Zymo Research Releases Free Software to Streamline COVID-19 Test Reporting
- Zymo Research Obtains CE IVD Mark for its Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit
- Zymo Research Obtains Emergency Use Authorization from FDA for Their Quick SARS-CoV-2 rRT-PCR Kit
- Zymo Research Receives CE IVD Mark for its Quick-DNA/RNA^™ Viral MagBead Kit
- Zymo Research Launches COVID-19 Sequencing Service for the Detection and Surveillance of Emerging SARS-CoV-2 Variants
- Zymo Research Offers Community-Wide SARS-CoV-2 Detection and Variant Tracking with the Environ^™COVID-19 Wastewater Testing Service
- Zymo Research Receives 510(k) Clearance for its Collection/Transport Device for COVID-19